119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1965 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.9 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  40.44 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  42.25 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  35.52 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  30 
 
 		 185 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  32 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.89 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.63 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  31.65 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  31.65 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  30.92 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.49 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  28.09 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  26.59 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.07 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  27.33 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  27.21 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  30.95 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  26.16 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.14 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  23.86 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  36.56 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  47.37 
 
 		 100 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  25.29 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.29 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  34.78 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  35.48 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  34.41 
 
 		 90 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  43.48 
 
 		 89 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  37.97 
 
 		 90 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.81 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  29.51 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.81 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.54 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  46.67 
 
 		 89 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  38.03 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  18.02 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  20.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  46.94 
 
 		 90 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  39.13 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  35.96 
 
 		 100 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  36.36 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  37.66 
 
 		 92 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  37.04 
 
 		 92 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  20.81 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  29.84 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  27.78 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.36 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  49.09 
 
 		 90 aa  47.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  45.65 
 
 		 94 aa  47.8  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  47.8  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  47.8  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  46.94 
 
 		 90 aa  47.8  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  29.84 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.41 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  46.15 
 
 		 88 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  39.13 
 
 		 112 aa  47.4  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  20.81 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  26.72 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  40.98 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  34.85 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  36 
 
 		 88 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  44.68 
 
 		 92 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0172  acetolactate synthase, small subunit  33.72 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.693447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  33.77 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  41.67 
 
 		 91 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  23.73 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  51.11 
 
 		 89 aa  45.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  32.58 
 
 		 89 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  23.21 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  28.46 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  32.58 
 
 		 288 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  39.66 
 
 		 288 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  42.55 
 
 		 92 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  43.75 
 
 		 95 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  35.29 
 
 		 90 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.29 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0612  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.56 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0971512  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  42.22 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  28.44 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  38.98 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  26.67 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  42.22 
 
 		 90 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  32.58 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.29 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  41.3 
 
 		 92 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.6 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  30.95 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  18.5 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  34.21 
 
 		 90 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  23.93 
 
 		 114 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>