148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0918 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  94.44 
 
 		 90 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  90 
 
 		 90 aa  165  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  82.22 
 
 		 90 aa  150  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  55.81 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  58.89 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  53.33 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  56.98 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  53.41 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  56.98 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  48.86 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  48.31 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  45.56 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  48.89 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  50 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  47.19 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  43.82 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  53.49 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  43.82 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  46.07 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  48.89 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  45.56 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  45.35 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  47.19 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  43.33 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  48.28 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  39.08 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  42.53 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  45.45 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  47.78 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  41.38 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  33.7 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.38 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  43.24 
 
 		 327 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  31.03 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  34.41 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  37.18 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  41.89 
 
 		 324 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  31.52 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  39.74 
 
 		 325 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  37.84 
 
 		 316 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.57 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.68 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.76 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  40.54 
 
 		 317 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2341  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  36.76 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2413  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.76 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204037  hitchhiker  0.00509125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  36.76 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1655  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  36.76 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  37.84 
 
 		 316 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  36.76 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  30.56 
 
 		 400 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1878  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  35.29 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42 
 
 		 418 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  35.71 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1701  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  35.29 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0560544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  46.94 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.71 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000275101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  32.89 
 
 		 405 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.89 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  42 
 
 		 418 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1791  amino acid-binding ACT domain protein  35.29 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000108735  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2553  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.29 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000108497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2668  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.29 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000549184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1739  putative glycine cleavage system transcriptional repressor  34.29 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03188  glycine cleavage system transcriptional repressor  37.14 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  35.94 
 
 		 429 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  38.57 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  34.67 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  36.49 
 
 		 287 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  37.18 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  42.03 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  38 
 
 		 429 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  36.62 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.94 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.65 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.65 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.65 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  35.44 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  35.44 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  42.03 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.65 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  45.65 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  35.44 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>