71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0156 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  174  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  77.27 
 
 
112 aa  140  7e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  51.14 
 
 
87 aa  87.8  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  48.31 
 
 
89 aa  87  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  49.44 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  44.32 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  47.19 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  48.86 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  48.84 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  43.18 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  44.32 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  43.18 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  40.91 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  47.67 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  47.67 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  45.88 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  40.7 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  46.59 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  42.7 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  41.57 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  43.18 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  40.91 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  37.08 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  44.83 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  44.94 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  39.77 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  42.05 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  40.91 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  39.77 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  43.82 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  35.96 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  39.33 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  39.77 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  37.93 
 
 
108 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  39.33 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  36.78 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  44.44 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  37.66 
 
 
316 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  35.53 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  45.16 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  49.06 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  36.36 
 
 
316 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  38.03 
 
 
183 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  45.65 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  37.04 
 
 
327 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.91 
 
 
186 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  36 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  28.38 
 
 
196 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  39.66 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.53 
 
 
183 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  42.22 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  31.46 
 
 
187 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  35.14 
 
 
317 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  39.34 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  29.49 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  36.11 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.29 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  52.5 
 
 
170 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  27.06 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.26 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  38.33 
 
 
173 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  52.5 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  33.77 
 
 
324 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  28 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  28 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>