90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3283 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  70.45 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  68.54 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  56.57 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  55.06 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  53.41 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  48.45 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  52.27 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  47.78 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  48.84 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  52.27 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  45.05 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  47.13 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  44.94 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  46.59 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  43.82 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  44.94 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  46.51 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  47.67 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  46.07 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  45.98 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  45.56 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  43.18 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  46.07 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  45.45 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  47.31 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  44.83 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  44.32 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  42.05 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  43.18 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  42.7 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  40.91 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  42.05 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  42.05 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  32.1 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  35.21 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  28.24 
 
 		 400 aa  47.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  33.8 
 
 		 316 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  38.03 
 
 		 324 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  32 
 
 		 325 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  36.62 
 
 		 327 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  31.58 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  35 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  31.03 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  35.62 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  33.33 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2479  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.93 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  34.52 
 
 		 289 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  30.51 
 
 		 404 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  35.53 
 
 		 287 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  30.59 
 
 		 429 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  27.96 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  33.8 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  28.09 
 
 		 398 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  31.87 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  32.53 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  26.51 
 
 		 429 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  35.8 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  34.67 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  28.81 
 
 		 404 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  35.44 
 
 		 183 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  26.51 
 
 		 418 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  36.25 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  34.21 
 
 		 287 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  32.1 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.09 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  32.43 
 
 		 288 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  28.05 
 
 		 411 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  31.91 
 
 		 294 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  28.57 
 
 		 284 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  33.78 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  25.29 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  34.67 
 
 		 288 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  28.38 
 
 		 421 aa  40  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  33.33 
 
 		 294 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  33.33 
 
 		 294 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>