60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2798 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  73.33 
 
 		 90 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  67.78 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  60 
 
 		 90 aa  120  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  61.11 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  60 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  56.82 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  53.41 
 
 		 89 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  48.31 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  48.86 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  48.89 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  51.14 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  47.73 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  52.27 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  48.86 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  47.19 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  48.89 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  46.07 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  42.7 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  46.59 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  47.73 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  39.08 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  39.33 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  47.78 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  43.33 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  41.11 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  47.73 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  48.86 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  38.2 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  42.05 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  40 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  34.83 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  40.91 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  37.08 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  41.11 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  38.64 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  40.79 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  39.73 
 
 		 325 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  39.47 
 
 		 327 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.67 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  40.3 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  34.21 
 
 		 316 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  34.21 
 
 		 316 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  36.84 
 
 		 317 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  28.4 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.64 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  32.89 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  34.21 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  34.21 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  35.53 
 
 		 196 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>