37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0278 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.97 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  24.72 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.32 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  21.51 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  27.45 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  21.91 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.86 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.34 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  23.86 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  23.86 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.82 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  22.73 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  25.42 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  25.75 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.87 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  32.89 
 
 		 88 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.74 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.44 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.98 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  21.47 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  32.89 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  28.38 
 
 		 88 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.98 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.92 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  24.71 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  32.08 
 
 		 93 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  21.11 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  34.04 
 
 		 92 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  29.17 
 
 		 89 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  25 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  26.67 
 
 		 89 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 		 400 aa  42  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  26.39 
 
 		 90 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  30.61 
 
 		 90 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  23.68 
 
 		 92 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  35.53 
 
 		 90 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>