103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0621 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  42.25 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.62 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  41.3 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  40 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  30.39 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  24.86 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  25.29 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  26.29 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.24 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.01 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  29.14 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  24.72 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  27.68 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  24.14 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  25.99 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  35.23 
 
 		 100 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.39 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  32.29 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.46 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  27.88 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  31.52 
 
 		 90 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.81 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.19 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  32.26 
 
 		 92 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  32.29 
 
 		 90 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  31.11 
 
 		 100 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  38.46 
 
 		 95 aa  51.6  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  26.55 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.06 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  24.74 
 
 		 405 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  31.96 
 
 		 93 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  25.41 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  27.27 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  29.63 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  28.42 
 
 		 90 aa  48.5  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  30.43 
 
 		 90 aa  48.5  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  31 
 
 		 108 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  27.12 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  31.91 
 
 		 92 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  25 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.17 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  31.52 
 
 		 90 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1246  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.8 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3131  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.8 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.590147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1361  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.8 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.243595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  28.09 
 
 		 92 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  32 
 
 		 88 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  30.68 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.43 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  28.4 
 
 		 90 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  27.62 
 
 		 114 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  34.38 
 
 		 89 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  29.55 
 
 		 90 aa  46.2  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  27.69 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  29.35 
 
 		 89 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  26.19 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  31.46 
 
 		 88 aa  44.7  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  26.58 
 
 		 178 aa  44.7  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  25.4 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  28.41 
 
 		 90 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  34.41 
 
 		 89 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.4 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  27.07 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  27.07 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.21 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.4 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.07 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.07 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.07 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  31.91 
 
 		 89 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  27.07 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  27.96 
 
 		 99 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  27.27 
 
 		 92 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  27.34 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.03 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.24 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002792  glycine cleavage system transcriptional antiactivator GcvR  24.17 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  29.59 
 
 		 112 aa  42.4  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2380  glycine cleavage system transcriptional repressor (Gcv operon repressor)  22.3 
 
 		 175 aa  42  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  26.06 
 
 		 189 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  33.85 
 
 		 89 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  28.87 
 
 		 90 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.6 
 
 		 172 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  19.05 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  22.76 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  24.03 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  27.27 
 
 		 93 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>