56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4121 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  100 
 
 
92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  46.07 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  48.86 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  46.07 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  47.13 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  43.82 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  49.44 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  43.82 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  44.94 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  43.68 
 
 
90 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  42.7 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  46.07 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  50.56 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  40.66 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  42.7 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  42.7 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  42.7 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  43.96 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  39.33 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  35.56 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  44.94 
 
 
88 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  42.05 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  40.91 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  42.7 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  42.86 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  37.08 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  39.08 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  41.57 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  40.45 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  38.2 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  39.13 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  35.96 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  38.2 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  38.2 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  39.33 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  37.93 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  39.33 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  39.33 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  35.96 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  37.08 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  33.71 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  36.92 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  45.65 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  35.53 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.28 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.26 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  27.27 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1863  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  31.58 
 
 
178 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000211112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  33.78 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.58 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.25 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1909  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  38 
 
 
175 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0700677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>