77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1270 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  189  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  77.17 
 
 
93 aa  143  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  68.54 
 
 
99 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  68.18 
 
 
100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  56.82 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  60.67 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  53.93 
 
 
90 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  54.55 
 
 
90 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  56.98 
 
 
89 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  53.41 
 
 
89 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  53.93 
 
 
90 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  52.81 
 
 
114 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  52.81 
 
 
108 aa  101  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  47.25 
 
 
92 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  48.31 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  49.44 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  48.35 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  44.94 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  92  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  47.19 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  50 
 
 
89 aa  87.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  52.81 
 
 
91 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  51.14 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  47.19 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  46.15 
 
 
95 aa  84  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  52.81 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  44.94 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  45.05 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  41.57 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  42.7 
 
 
92 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  38.64 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  43.18 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  39.33 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.07 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  46.05 
 
 
183 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  38.67 
 
 
325 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  30.59 
 
 
400 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  33.8 
 
 
316 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  45.65 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  33.8 
 
 
316 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  30 
 
 
183 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  30.23 
 
 
398 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  38.03 
 
 
327 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  38.03 
 
 
317 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  36.62 
 
 
324 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  33.33 
 
 
410 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  31.46 
 
 
404 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  32.26 
 
 
429 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  29.69 
 
 
438 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  32.81 
 
 
404 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  35.21 
 
 
404 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  37.97 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  34.38 
 
 
411 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  32.26 
 
 
418 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  30.26 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  29.33 
 
 
406 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  32.26 
 
 
418 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  35.19 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  31.25 
 
 
412 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  32.81 
 
 
429 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.89 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  33.78 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  28.85 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  48.84 
 
 
189 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>