56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1174 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  100 
 
 		 112 aa  224  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  68.18 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  64.77 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  57.95 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  59.09 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  57.95 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  56.82 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  47.73 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  47.73 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  49.44 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  48.86 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  48.31 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  51.14 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  40.91 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  45.45 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  44.94 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  43.18 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  38.38 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  43.88 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  46.59 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  38.95 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  40.91 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  39.77 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  39.77 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  41.38 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  41.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  46.59 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  43.68 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  41.57 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  39.53 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  35.96 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  41.86 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  40.23 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  40.54 
 
 		 324 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  33.71 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  36.49 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  38.2 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  39.19 
 
 		 327 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  40.54 
 
 		 325 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  33.78 
 
 		 316 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  30.21 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  39.44 
 
 		 317 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.48 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  29.59 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  28.09 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  42 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>