126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0479 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.99 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  44.81 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  40.44 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  40 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.71 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  27.01 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  32.37 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  29.76 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.82 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  26.59 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  30.81 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  28.99 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  25.6 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.82 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  25 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.03 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.48 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  28.74 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  27.22 
 
 		 400 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  26.26 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  26.26 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.21 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  33.7 
 
 		 90 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.65 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  26.14 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  36.08 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  38.46 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  46.05 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  31.52 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  32.26 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  21.91 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  44.12 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  45.31 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  48 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  27.64 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  51.02 
 
 		 90 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  29.35 
 
 		 89 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  40.26 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  31.18 
 
 		 92 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  40.28 
 
 		 90 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  38.89 
 
 		 90 aa  53.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  28.23 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  44 
 
 		 92 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  44.64 
 
 		 90 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  35.62 
 
 		 89 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02371  DNA-binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1190  amino acid-binding ACT domain protein  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  32.22 
 
 		 90 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2611  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.82 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2761  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.82 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1197  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2626  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2851  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.82 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3701  glycine cleavage system transcriptional repressor  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02333  hypothetical protein  31.82 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.11 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  51.2  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  38.81 
 
 		 95 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  45.65 
 
 		 87 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  33.85 
 
 		 89 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  52.27 
 
 		 92 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.24 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  40.3 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  43.4 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2683  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.3 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2749  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.3 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2724  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.3 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2635  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.3 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2856  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.3 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  36.62 
 
 		 89 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1071  amino acid-binding ACT domain protein  28.03 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  26.26 
 
 		 420 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  37.31 
 
 		 90 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  35.21 
 
 		 89 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2975  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.66 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  40.38 
 
 		 90 aa  48.9  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  31.4 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  23.86 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.7 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  28.12 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  36.92 
 
 		 92 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  35.82 
 
 		 108 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 99 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  41.18 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.79 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  47.62 
 
 		 89 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  25.56 
 
 		 421 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  27.27 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  21.39 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  38 
 
 		 92 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  43.18 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  23.04 
 
 		 410 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>