72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1470 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  77.27 
 
 
88 aa  140  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  59.09 
 
 
87 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  53.93 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  48.86 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  50.56 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  47.73 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  46.59 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  48.31 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  51.16 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  46.59 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  47.31 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  43.88 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  50.56 
 
 
92 aa  77  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  43.82 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  48.28 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  43.18 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  44.94 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  44.94 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  44.83 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  41.86 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  43.82 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  45.45 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  37.08 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  44.32 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  41.84 
 
 
100 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  44.32 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  42.05 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  40.45 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  38.32 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  38.64 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  43.82 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  41.38 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  41.86 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  38.64 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  44.12 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  37.65 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  54.35 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.74 
 
 
186 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  41.86 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  37.66 
 
 
316 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  41.33 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.79 
 
 
183 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  48.21 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  45 
 
 
188 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.86 
 
 
188 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  36.36 
 
 
316 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  35.8 
 
 
327 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  39.13 
 
 
183 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  43.1 
 
 
188 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  32.89 
 
 
196 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  38.98 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  41.27 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  40.58 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  36.76 
 
 
317 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.83 
 
 
181 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  30.67 
 
 
173 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  30.67 
 
 
173 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  35.06 
 
 
324 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.26 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  27.38 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3510  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.99 
 
 
228 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.261645  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  37.88 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>