77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1671 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  68.18 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  56.57 
 
 		 99 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  66.29 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  49.45 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  49.45 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  49.45 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  49.43 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  52.33 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  51.14 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  48.84 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  95.9  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  51.14 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  47.73 
 
 		 114 aa  93.6  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  46.59 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  43.68 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  41.49 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  48.86 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  45.35 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  43.18 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  37.89 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  41.86 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  42.7 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  41.84 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  43.18 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  42.05 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  38.64 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  39.77 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.48 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  47.37 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  47.17 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  33.78 
 
 		 316 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  31.11 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  42.62 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  34.72 
 
 		 316 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  40.98 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  40.96 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  32.47 
 
 		 325 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  32.26 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  32.43 
 
 		 324 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  33.78 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  35.71 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  26.39 
 
 		 400 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  31.08 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  35.21 
 
 		 317 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  33.78 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.07 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  27.38 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  35.59 
 
 		 398 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.68 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  28.74 
 
 		 404 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.44 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  36 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  48.84 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  30.49 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0223  formyl transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  25.58 
 
 		 398 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  36.54 
 
 		 404 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.84 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  25.81 
 
 		 438 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>