More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3492 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3492  response regulator receiver protein  100 
 
 		 160 aa  317  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.76 
 
 		 277 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.26 
 
 		 254 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  64.71 
 
 		 250 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  63.21 
 
 		 275 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.74 
 
 		 264 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 260 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3500  response regulator receiver  54 
 
 		 356 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53 
 
 		 320 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 255 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.35 
 
 		 248 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  43.01 
 
 		 230 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  36.08 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  39.05 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0087  two component transcriptional regulator  39.8 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  38.14 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 265 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  40.86 
 
 		 240 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  34.69 
 
 		 265 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  34.69 
 
 		 265 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  34.69 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2564  two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  41.98 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.62 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2598  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.43 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  38.14 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  38.14 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  34.29 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2094  response regulator receiver  34.65 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.31 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  40.38 
 
 		 219 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  32.67 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  31.69 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.34 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.46 
 
 		 246 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.17 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0712  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  32.63 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  35.46 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  36.08 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  32.35 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1805  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  39.8 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.31 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  34.04 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  26.17 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  26.17 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  31.76 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3491  transcriptional regulator domain-containing protein  36.9 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  34.86 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.28 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  33.94 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.35 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4558  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  34.09 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  33.67 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>