246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2306 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  862    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  87.67 
 
 
430 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  55.36 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  54.2 
 
 
472 aa  435  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  34.07 
 
 
462 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  32.45 
 
 
464 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  29.65 
 
 
446 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  31.45 
 
 
476 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  34.28 
 
 
458 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  36.01 
 
 
436 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  33.19 
 
 
463 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  33.91 
 
 
474 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  32.8 
 
 
448 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  32.8 
 
 
448 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  30.64 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  32.67 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  33.26 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  32.54 
 
 
474 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  31.98 
 
 
491 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  33.63 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  31.59 
 
 
447 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  34.33 
 
 
469 aa  176  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.8 
 
 
452 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  30.47 
 
 
467 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  31.29 
 
 
507 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.69 
 
 
445 aa  166  9e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  28.73 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  30.65 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  28.67 
 
 
451 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  31.11 
 
 
467 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.63 
 
 
449 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.19 
 
 
455 aa  156  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  28.09 
 
 
443 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.06 
 
 
455 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  27.88 
 
 
446 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  27.91 
 
 
447 aa  142  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  32.16 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  26.93 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  26.93 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  28 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  32.03 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  25.6 
 
 
437 aa  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  30.59 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  31.21 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  30.97 
 
 
413 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  27.13 
 
 
444 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  30.73 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  30.73 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  30.9 
 
 
425 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  30 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  33.8 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  31.18 
 
 
412 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  29.41 
 
 
429 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  31.51 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  32.47 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  32.24 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  30.39 
 
 
425 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  30.79 
 
 
406 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  28.51 
 
 
424 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  30.98 
 
 
416 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  37.79 
 
 
744 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  31.25 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  30.86 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  28.22 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  25.17 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  31.61 
 
 
470 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0448  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  29.06 
 
 
471 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.483949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  37.9 
 
 
421 aa  60.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0767  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  34.27 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.18 
 
 
455 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2204  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  26.42 
 
 
450 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1072  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  30.77 
 
 
502 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1105  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  25.75 
 
 
536 aa  54.7  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.933873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1793  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/ D-alanyl-D-alanyl ligase  29.94 
 
 
458 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  normal  0.597018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.64 
 
 
449 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3060  UDP-N-acetylmuramate  29.53 
 
 
477 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1468  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  34.68 
 
 
650 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  31.3 
 
 
472 aa  53.9  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05211  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.07 
 
 
460 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1615  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  30.13 
 
 
443 aa  53.5  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0958  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  30.15 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.205963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2861  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  29.01 
 
 
457 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5795  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanylligase  33.73 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27430  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  31.16 
 
 
458 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.1992  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1049  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.78 
 
 
466 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148666  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0949  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.31 
 
 
481 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3502  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  30.92 
 
 
456 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.464262  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2868  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  30.77 
 
 
465 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0485127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6176  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.55 
 
 
466 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1119  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.87 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1405  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  27.34 
 
 
462 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0862539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3488  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.62 
 
 
468 aa  50.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0744  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  30 
 
 
444 aa  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1073  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  26.39 
 
 
587 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.312331  normal  0.927844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3127  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.87 
 
 
471 aa  49.7  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3543  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.87 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1103  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate ligase  26.57 
 
 
533 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.964101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0471  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.87 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1330  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.87 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3524  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.87 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>