More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1153 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
474 aa  979    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  56.96 
 
 
466 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  53.36 
 
 
469 aa  488  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  51.27 
 
 
463 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  44.4 
 
 
464 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  43.1 
 
 
476 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  40.59 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  37.31 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  37.9 
 
 
467 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  39.7 
 
 
444 aa  307  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  37.01 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  37.23 
 
 
462 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  35.93 
 
 
437 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  35.93 
 
 
437 aa  300  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  40.3 
 
 
463 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  38.38 
 
 
474 aa  289  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  37.42 
 
 
491 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  34.63 
 
 
446 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  34.57 
 
 
445 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  36.81 
 
 
507 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  39.14 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  38.83 
 
 
456 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  38.94 
 
 
436 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.28 
 
 
449 aa  261  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  34.83 
 
 
448 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  36.38 
 
 
458 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  34.83 
 
 
448 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  34.35 
 
 
447 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  33.05 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  35.04 
 
 
451 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  35.04 
 
 
451 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  32.39 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  32.53 
 
 
441 aa  239  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  33.69 
 
 
744 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  34.77 
 
 
445 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.95 
 
 
445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.34 
 
 
452 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  30.15 
 
 
443 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.05 
 
 
455 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.54 
 
 
490 aa  200  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  34.43 
 
 
430 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  31.22 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  33.26 
 
 
429 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  32.85 
 
 
394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  31.33 
 
 
411 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  29.8 
 
 
412 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  29.49 
 
 
429 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  30.77 
 
 
418 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.95 
 
 
445 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  31.9 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  32.5 
 
 
408 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  32.5 
 
 
408 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  32.73 
 
 
413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  31.78 
 
 
425 aa  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  30.11 
 
 
418 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  28.73 
 
 
424 aa  153  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  31.7 
 
 
412 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  33.49 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  30 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  32.03 
 
 
425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  31.58 
 
 
416 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  32.49 
 
 
406 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  29.04 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  29.63 
 
 
415 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  31.85 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  29 
 
 
408 aa  128  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  29.46 
 
 
410 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0480  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  24.86 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000047898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  22.54 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000230391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  26.97 
 
 
894 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2414  Mur ligase family protein  24.13 
 
 
401 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00339863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  23.72 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  23.78 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000060186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0656  UDP-N-acetylmuramate  25.07 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate ligase  23.33 
 
 
492 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00917658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.33 
 
 
455 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0243  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  22.19 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.390726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  24.16 
 
 
449 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  30.41 
 
 
489 aa  61.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1273  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  23.08 
 
 
498 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.955729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1300  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  21.36 
 
 
442 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.432569  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4068  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  24.78 
 
 
495 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0686  UDP-N-acetylmuramate  25 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2094  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.55 
 
 
475 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0467874  hitchhiker  0.00000530734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  30.18 
 
 
447 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0676  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.57 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3147  UDP-N-acetylmuramate  23.46 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  24.73 
 
 
871 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0820  UDP-N-acetylmuramate  23.15 
 
 
465 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.700017  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0791  UDP-N-acetylmuramate  23.46 
 
 
465 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2629  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  27.59 
 
 
499 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0827  UDP-N-acetylmuramate  22.22 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2207  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.94 
 
 
507 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0838  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.91 
 
 
499 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  30.41 
 
 
908 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1717  hypothetical protein  25.08 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0448  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  27.45 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.483949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1662  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  29.87 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3235  UDP-N-acetylmuramate  24.29 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0293  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  27.32 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>