More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1785 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
446 aa  898    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  39.06 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  41.35 
 
 
444 aa  297  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  37.69 
 
 
446 aa  289  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  35.67 
 
 
462 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  37.18 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  37.42 
 
 
467 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  34.63 
 
 
474 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  34.39 
 
 
467 aa  256  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  34.53 
 
 
447 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  36.26 
 
 
469 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  33.04 
 
 
463 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  35.16 
 
 
437 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  35.16 
 
 
437 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.24 
 
 
449 aa  248  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  32.88 
 
 
443 aa  246  6e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  33.26 
 
 
437 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  36 
 
 
455 aa  237  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  33.93 
 
 
441 aa  237  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  32.4 
 
 
445 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  33.04 
 
 
445 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  35.13 
 
 
445 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  35.47 
 
 
466 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  31.91 
 
 
744 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  33.04 
 
 
447 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  31.88 
 
 
463 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  32.02 
 
 
436 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  33.79 
 
 
451 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.81 
 
 
455 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  36.52 
 
 
456 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  31.03 
 
 
491 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  33.79 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  31.12 
 
 
448 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  31.12 
 
 
448 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.95 
 
 
452 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  31.89 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  31.69 
 
 
474 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  28.14 
 
 
507 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.8 
 
 
445 aa  196  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  29.95 
 
 
418 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  26.38 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  28.6 
 
 
418 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  31.93 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  26.58 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.22 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  30.38 
 
 
417 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  27.25 
 
 
394 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  25.79 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  26.77 
 
 
424 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  27.12 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  26.06 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  27.06 
 
 
421 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.8 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  29.55 
 
 
470 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  26.33 
 
 
429 aa  123  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  27.32 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  26.23 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  24.32 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  24.32 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  24.04 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  24.32 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  27.54 
 
 
410 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  23.35 
 
 
413 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  28.07 
 
 
412 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  23.49 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  24.04 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  24.04 
 
 
420 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3325  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.24 
 
 
451 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148113  normal  0.545808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0509  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.58 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.24 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6979  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.3 
 
 
463 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0152734  hitchhiker  0.0000000420248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3973  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.4 
 
 
458 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  22.7 
 
 
491 aa  64.3  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.96 
 
 
471 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  25.14 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000230391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2320  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.76 
 
 
494 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0792062  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6171  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.86 
 
 
467 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.0868865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3068  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.6 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2872  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  24.01 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3288  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.85 
 
 
460 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3487  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.55 
 
 
468 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.506219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0546  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain-containing protein  23.6 
 
 
477 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.79 
 
 
468 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.22 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.417926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4537  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  20.79 
 
 
455 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0409  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.95 
 
 
462 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0959029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0051  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate-D-alanyl-D-alanyl ligase  22.5 
 
 
476 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.577094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0413  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.19 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3393  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.2 
 
 
467 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.387942  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0089  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.24 
 
 
445 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  24.23 
 
 
493 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000060186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  24.37 
 
 
885 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.85 
 
 
455 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2786  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  21.92 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28 
 
 
472 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  27.44 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4532  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25 
 
 
489 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323357  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0815  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.97 
 
 
493 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1996  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.9 
 
 
468 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0811  Mur ligase family protein  20.25 
 
 
478 aa  53.9  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.759214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>