145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0648 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
412 aa  834    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  69.79 
 
 
424 aa  565  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  65.28 
 
 
429 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  62.29 
 
 
418 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  58.95 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  57.66 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  54.78 
 
 
415 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  54.85 
 
 
420 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  50 
 
 
411 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  47.04 
 
 
394 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  46.31 
 
 
412 aa  322  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  46.37 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  46.37 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  46.63 
 
 
408 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  48.19 
 
 
421 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  45.93 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  44.53 
 
 
413 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  44.8 
 
 
416 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  46.63 
 
 
406 aa  299  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  42.63 
 
 
425 aa  293  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  43.37 
 
 
417 aa  292  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  30.82 
 
 
447 aa  188  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.68 
 
 
449 aa  186  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  31.41 
 
 
445 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  29.98 
 
 
462 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  29.16 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  30.94 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  30.94 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  31.64 
 
 
441 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  30 
 
 
445 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  32.59 
 
 
463 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  33.62 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.95 
 
 
455 aa  173  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  34.61 
 
 
408 aa  172  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  30 
 
 
447 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  33.02 
 
 
458 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  27.52 
 
 
443 aa  168  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  28.19 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  29.27 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  29.27 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.6 
 
 
452 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  31.65 
 
 
744 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  34.05 
 
 
436 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  32.22 
 
 
491 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  31.36 
 
 
469 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.41 
 
 
455 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  26.47 
 
 
451 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  26.47 
 
 
451 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  26.38 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  28.25 
 
 
464 aa  150  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  26.15 
 
 
467 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  30.68 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  30.18 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  27.75 
 
 
444 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  26.59 
 
 
446 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.4 
 
 
445 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  29.8 
 
 
474 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  27.42 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  30.95 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  31.07 
 
 
507 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  30.9 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  27.59 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  25.81 
 
 
445 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  29.84 
 
 
430 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  24.94 
 
 
470 aa  96.3  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  39.55 
 
 
490 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  30.8 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  25.47 
 
 
471 aa  62.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6976  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  29.55 
 
 
446 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.282447  hitchhiker  0.0000349353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4218  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.5 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.9 
 
 
489 aa  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.35 
 
 
455 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.94 
 
 
460 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0488  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.83 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6171  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.19 
 
 
467 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.0868865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3825  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  27.62 
 
 
462 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2094  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.82 
 
 
475 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0467874  hitchhiker  0.00000530734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3909  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  27.62 
 
 
462 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.18 
 
 
472 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.3 
 
 
455 aa  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0849  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.24 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4532  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.17 
 
 
489 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323357  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.34 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.417926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2598  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  24.9 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211888  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0050  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  25.83 
 
 
516 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.046851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3569  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.32 
 
 
488 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0387  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.91 
 
 
488 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110933  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3742  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.91 
 
 
488 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113506  hitchhiker  0.000000337645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  24.14 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0583  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.9 
 
 
464 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000310292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26 
 
 
449 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0384  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.11 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.541458  normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0205  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  24.11 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2192  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  27.13 
 
 
455 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3452  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.34 
 
 
484 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2858  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  25.29 
 
 
477 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.769663  decreased coverage  0.00311038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3803  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.73 
 
 
485 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.595794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0355  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.75 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1280  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.64 
 
 
467 aa  46.6  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.797916  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25 
 
 
477 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00131729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>