140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1706 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  820    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  48.19 
 
 
412 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  47.98 
 
 
424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  46.73 
 
 
429 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  47.72 
 
 
418 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  46.96 
 
 
418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  47.34 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  48.06 
 
 
417 aa  302  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  46.86 
 
 
411 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  48.53 
 
 
410 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  47.37 
 
 
415 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  47.37 
 
 
420 aa  285  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  45.62 
 
 
425 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  46.62 
 
 
394 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  45.84 
 
 
408 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  45.59 
 
 
408 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  45.59 
 
 
408 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  45.39 
 
 
412 aa  266  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  46.33 
 
 
413 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  45.09 
 
 
406 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  44.58 
 
 
425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  35.7 
 
 
462 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  37.41 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  41.07 
 
 
408 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  35.43 
 
 
463 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  36.89 
 
 
474 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  36.04 
 
 
491 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  31.53 
 
 
445 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.11 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.36 
 
 
449 aa  167  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  32.25 
 
 
447 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  36.61 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  29.77 
 
 
445 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  30.79 
 
 
448 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  29.49 
 
 
445 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  28.68 
 
 
446 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  30.79 
 
 
448 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  29.82 
 
 
441 aa  160  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  29.44 
 
 
467 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  29.48 
 
 
447 aa  159  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  28.5 
 
 
437 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  28.93 
 
 
437 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  28.93 
 
 
437 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.36 
 
 
452 aa  153  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  34.51 
 
 
507 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.85 
 
 
455 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  27.96 
 
 
444 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  35.08 
 
 
744 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  31.75 
 
 
476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  27.43 
 
 
443 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  36.54 
 
 
436 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  27.06 
 
 
446 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  29.52 
 
 
464 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.93 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  28.23 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  27.17 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  32.25 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  33.82 
 
 
463 aa  137  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  27.13 
 
 
451 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  30.22 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  31.85 
 
 
474 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  32.24 
 
 
456 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  33.84 
 
 
430 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  31.7 
 
 
429 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.25 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  38.46 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  25.52 
 
 
470 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3443  UDP-N-acetylmuramate  29.76 
 
 
448 aa  60.1  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0518  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  29.93 
 
 
489 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3060  UDP-N-acetylmuramate  30.2 
 
 
477 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05211  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.1 
 
 
460 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1972  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  29.83 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2865  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate-D-alanyl-D-alanyl ligase  26.92 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2051  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  29.39 
 
 
468 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  25.33 
 
 
894 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.36 
 
 
449 aa  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2153  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.73 
 
 
461 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.136521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1037  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  28.4 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1486  UDP-N-acetylmuramate  29.92 
 
 
491 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486018  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1491  UDP-N-acetylmuramate  28.57 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1408  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  27.78 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0738105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.34 
 
 
472 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0115  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  24.17 
 
 
464 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0448444  normal  0.0314299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2401  UDP-N-acetylmuramate  26.33 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0463  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.69 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.132018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.13 
 
 
460 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3235  UDP-N-acetylmuramate  24.37 
 
 
479 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157661  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3479  hypothetical protein  29.09 
 
 
1279 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.165023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1717  hypothetical protein  23.76 
 
 
455 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2121  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  24.78 
 
 
451 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4218  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.25 
 
 
488 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2861  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  29.92 
 
 
457 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3692  UDP-N-acetylmuramate/L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  30.2 
 
 
449 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0511  UDP-N-acetylmuramate  31.12 
 
 
461 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0535  UDP-N-acetylmuramate  31.12 
 
 
461 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3026  UDP-N-acetylmuramate  28.46 
 
 
461 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2103  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.77 
 
 
465 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0051  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate-D-alanyl-D-alanyl ligase  26.95 
 
 
476 aa  47  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.577094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1782  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  32.72 
 
 
548 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0408  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  33.59 
 
 
470 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>