135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1233 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  81.63 
 
 
447 aa  764    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  69.93 
 
 
449 aa  641    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  100 
 
 
441 aa  911    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  53.76 
 
 
445 aa  484  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  48.53 
 
 
455 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  48.09 
 
 
452 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  44.87 
 
 
445 aa  366  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  41.87 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  41.82 
 
 
451 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  41.82 
 
 
451 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  35.9 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  35.32 
 
 
467 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  33.85 
 
 
462 aa  253  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  36.19 
 
 
476 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  35.52 
 
 
464 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  33.93 
 
 
446 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  33.56 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  37.47 
 
 
437 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  37.47 
 
 
437 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  36.67 
 
 
437 aa  227  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  34.34 
 
 
463 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  34.61 
 
 
466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  32.53 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  33.49 
 
 
446 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  32.09 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  33.33 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.78 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  31.88 
 
 
445 aa  203  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  31.47 
 
 
507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  31.08 
 
 
491 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  33.56 
 
 
474 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  32.05 
 
 
448 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  32.05 
 
 
448 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  30.07 
 
 
447 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  33.41 
 
 
444 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  32.96 
 
 
445 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  31.13 
 
 
436 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  35.63 
 
 
456 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  31.64 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  30.73 
 
 
744 aa  176  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  29.44 
 
 
429 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  28.88 
 
 
408 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  28.88 
 
 
408 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  30.43 
 
 
425 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  28.64 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.39 
 
 
445 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  28.64 
 
 
413 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  30.68 
 
 
418 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.45 
 
 
490 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  30.26 
 
 
424 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  30.04 
 
 
472 aa  153  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  28.37 
 
 
418 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  30.24 
 
 
410 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  28.6 
 
 
425 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  29.3 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  29.37 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  29.82 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  28.5 
 
 
420 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  27.92 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  30.68 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  28.04 
 
 
415 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  25.93 
 
 
411 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  29.66 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  28.57 
 
 
430 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  29.21 
 
 
408 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  28 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  25.46 
 
 
470 aa  114  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09040  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  28.26 
 
 
499 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6979  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.45 
 
 
463 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0152734  hitchhiker  0.0000000420248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  33.33 
 
 
460 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1231  hypothetical protein  21.97 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0464953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2103  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  34.91 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.91 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  22.73 
 
 
457 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000230391  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0779  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  34.91 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230521  normal  0.687569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2192  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.88 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0589  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  36.46 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2456  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  23.66 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3788  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  23.95 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0893617  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  27.54 
 
 
473 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4635  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.69 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0173708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1685  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31 
 
 
460 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5174  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.69 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5098  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.69 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0354  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  23.4 
 
 
464 aa  48.5  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0725  UDP-N-acetylmuramate  24.33 
 
 
466 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.729179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0690  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  33.96 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3426  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.79 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.294637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0773  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  23.45 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.03528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0584  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  26.71 
 
 
461 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1277  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29 
 
 
466 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5795  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanylligase  26.22 
 
 
447 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3396  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  32 
 
 
470 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.92 
 
 
489 aa  47.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3497  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.77 
 
 
463 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0772832  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4067  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  21.87 
 
 
482 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09530  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  22.34 
 
 
485 aa  46.6  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0848921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0204  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  24.15 
 
 
463 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.516376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1085  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  24.55 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2268  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.39 
 
 
475 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0144942 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>