More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1392 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  100 
 
 		 451 aa  914    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  99.56 
 
 		 451 aa  907    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  43.27 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  41.82 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  43.69 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  41.8 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  40.77 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  42.06 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  42.03 
 
 		 467 aa  345  7e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  40.67 
 
 		 452 aa  343  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  41.06 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  38.85 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  34.85 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  38.44 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  32.68 
 
 		 458 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  35.29 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  35.29 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  36.68 
 
 		 437 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  35.54 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  35.56 
 
 		 463 aa  265  8.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  34.39 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  38.44 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  32.76 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.41 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  35.04 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  34.67 
 
 		 466 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  31.89 
 
 		 491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  33.71 
 
 		 469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  33.48 
 
 		 445 aa  243  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  35.29 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  33.41 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  33.26 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  33.26 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  32.68 
 
 		 445 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  31.39 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  31.29 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  32.81 
 
 		 744 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  31.17 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  31.58 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.41 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  27.81 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  28.61 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  28.84 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  28.61 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  28.34 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  26.47 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  28.75 
 
 		 472 aa  173  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  28.67 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  27.19 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  27.9 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  30.58 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  27.9 
 
 		 425 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  28.73 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  27.9 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  26 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  27.31 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  28.15 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  27.29 
 
 		 411 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  28.04 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  26.05 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  26.1 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  27.35 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  25.28 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  26.36 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  27.65 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  27.68 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.88 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.81 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.73 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0509  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.19 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0669  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.21 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0584  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  25.22 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2843  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.1 
 
 		 483 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1829  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  27.41 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2428  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  26.48 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2835  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.81 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0068259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0489  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.81 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2723  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.1 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0464  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.81 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0531  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.81 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298409  normal  0.578451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0078  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.81 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0560  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.81 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3646  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.81 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3469  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.1 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0154582  hitchhiker  0.00481744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3946  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.81 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3497  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.29 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0772832  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2537  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.5 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0384  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.48 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.541458  normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3088  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.74 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.47524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1563  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  33.33 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0205  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  25.48 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3416  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.67 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0120  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.8 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3973  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.09 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2672  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.1 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.02 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0487  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.71 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0920  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.79 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3288  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.61 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2978  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.98 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>