88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1442 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 		 408 aa  801    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  36.64 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  37.15 
 
 		 408 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  37.15 
 
 		 408 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  39.74 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  38.15 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  37.4 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  37.76 
 
 		 418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  38.38 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  38.54 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  38.21 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  36.9 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  36.62 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  36.52 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  36.14 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  35.25 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  41.07 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  36.81 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  35.52 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.12 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  36.16 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  36.16 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  37.34 
 
 		 410 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  26.9 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  33.73 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  29.47 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  33.25 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.72 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  30.23 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  30.23 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  28.44 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  27.36 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  29.21 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  30.68 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  28.74 
 
 		 445 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.17 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  27.2 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  30.6 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.46 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  28.28 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  27.21 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  30.89 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  32.42 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  27.73 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  27.29 
 
 		 448 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  27.29 
 
 		 448 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  32.25 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  31.05 
 
 		 474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  31.18 
 
 		 744 aa  126  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  34.47 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  33.8 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  29.05 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  30.6 
 
 		 491 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.36 
 
 		 455 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  27.33 
 
 		 464 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  28.11 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  28.15 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  27.45 
 
 		 467 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  29.35 
 
 		 507 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  27.13 
 
 		 467 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.31 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  27.82 
 
 		 472 aa  99  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  29.2 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  25.64 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.57 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  28.22 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0524  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.78 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5098  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.62 
 
 		 455 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4635  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.8 
 
 		 455 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0173708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3631  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  31.25 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3521  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  32.93 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2153  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.71 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.136521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1956  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  40.66 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0489  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  28.12 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3825  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  35.25 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3769  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  35.25 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.646237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3909  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  35.25 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2359  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  35.29 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0150548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3669  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  34.83 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00445508  normal  0.10958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0589  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  38.71 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0690  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  37.21 
 
 		 465 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6976  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  35.42 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.282447  hitchhiker  0.0000349353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1992  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  38.1 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00736654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2646  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  36.9 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0506  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  28.12 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1596  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  32.54 
 
 		 895 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1049  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  36.56 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>