218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1788 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  100 
 
 
452 aa  922    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  57.69 
 
 
445 aa  514  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  56.76 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  51.2 
 
 
455 aa  449  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  50 
 
 
449 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  47.45 
 
 
447 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  48.09 
 
 
441 aa  412  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  43.65 
 
 
443 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  40.67 
 
 
451 aa  323  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  40.67 
 
 
451 aa  322  7e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  39.86 
 
 
467 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  34.19 
 
 
467 aa  259  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  33.98 
 
 
462 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  34.6 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  34.6 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  32.95 
 
 
446 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  32.33 
 
 
464 aa  217  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  33.74 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  33.6 
 
 
437 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  35.96 
 
 
444 aa  212  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.49 
 
 
455 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  33.64 
 
 
446 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  31.66 
 
 
445 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  33.33 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  31.89 
 
 
476 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  32.36 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  31.33 
 
 
469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  32.45 
 
 
447 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  30.58 
 
 
744 aa  196  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  30.47 
 
 
463 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  31.34 
 
 
474 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  31.57 
 
 
436 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  31 
 
 
507 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  31.26 
 
 
466 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  31.18 
 
 
448 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  31.18 
 
 
448 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  31.12 
 
 
463 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  30.85 
 
 
445 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  31.37 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  31.98 
 
 
456 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  29.13 
 
 
413 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.15 
 
 
490 aa  167  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  29.47 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  29.47 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  29.47 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  30.83 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  28.6 
 
 
412 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  27.62 
 
 
424 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  27.41 
 
 
429 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.75 
 
 
445 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  28.86 
 
 
425 aa  153  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  27.87 
 
 
412 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  29.23 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  30.07 
 
 
430 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  30.8 
 
 
429 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  30.5 
 
 
417 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  26.67 
 
 
415 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  26.77 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  27.66 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  26.09 
 
 
411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  30.05 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  30.36 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  27.34 
 
 
410 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  29.25 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  28.24 
 
 
408 aa  127  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  27.21 
 
 
418 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  28.39 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2451  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.07 
 
 
464 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  23.25 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000230391  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05211  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  32.26 
 
 
460 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2153  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.69 
 
 
461 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.136521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15291  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  22.69 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3788  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  25.34 
 
 
468 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0893617  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0204  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  23.1 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.516376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  32.38 
 
 
460 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3631  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  27.17 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1685  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.51 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1845  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.55 
 
 
537 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6176  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.64 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2094  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.81 
 
 
475 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0467874  hitchhiker  0.00000530734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2192  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  24.81 
 
 
466 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0243  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  20.94 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.390726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3396  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.02 
 
 
470 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2893  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  32.46 
 
 
471 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1408  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.01 
 
 
472 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0738105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1992  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  25.83 
 
 
466 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00736654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0849  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  32.81 
 
 
474 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.51 
 
 
479 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2359  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.08 
 
 
454 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0150548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  31.71 
 
 
472 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1968  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.3 
 
 
477 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0316215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.68 
 
 
471 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2103  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  25.26 
 
 
465 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0779  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  25.26 
 
 
465 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230521  normal  0.687569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1049  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.02 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148666  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0486  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  27.59 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.78 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00131729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1956  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  23.71 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0503  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  27.84 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3543  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.51 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>