237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1208 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  100 
 
 		 449 aa  925    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  69.93 
 
 		 441 aa  641    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  67.19 
 
 		 447 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  54.69 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  50 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  48.53 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  46.29 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  42.89 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  43.27 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  43.05 
 
 		 451 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  37.11 
 
 		 467 aa  295  8e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  37.73 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  35.79 
 
 		 464 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  34.62 
 
 		 458 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  36.43 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  35.92 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  35.24 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  31.83 
 
 		 462 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  34.28 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  35.56 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  35.56 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  33.12 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  33.92 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  36.73 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  32.59 
 
 		 469 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  33.11 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  32.89 
 
 		 466 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  33.18 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  32.39 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  30.83 
 
 		 491 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  34.15 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.4 
 
 		 455 aa  212  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  31.93 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  33.72 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  32.4 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  32.4 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  30.38 
 
 		 744 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  31.01 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  31.82 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  29.68 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.85 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  28.44 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.13 
 
 		 490 aa  166  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  31.83 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  29.19 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  29.19 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  29.59 
 
 		 408 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  27.71 
 
 		 411 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  28.3 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  29.16 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  29.2 
 
 		 394 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  29.5 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  31.08 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  29.24 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  29.73 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  28.76 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  27.62 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  28.35 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  29.59 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  30.64 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  30.63 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  29.08 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  29.76 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  28.5 
 
 		 406 aa  143  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  27.38 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  31.4 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  27.49 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3973  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.04 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0509  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.74 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.3 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0669  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.57 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3416  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.86 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2700  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.59 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.63 
 
 		 491 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3288  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.69 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  24.05 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000230391  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3426  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.34 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.294637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.45 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0676  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.16 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.66 
 
 		 455 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2268  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.81 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0955  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.76 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.364544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0205  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  24.71 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0752  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.17 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2456  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  21.45 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0384  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.71 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.541458  normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5795  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanylligase  27.04 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0849  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.7 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3127  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.56 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0725  UDP-N-acetylmuramate  23.15 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3452  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.54 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.76 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  28.1 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0518  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  24.26 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2978  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.19 
 
 		 475 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2723  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.66 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3088  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.66 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.47524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0355  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.42 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1148  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  28.03 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3946  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.57 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>