270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0013 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
444 aa  887    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  39.15 
 
 
464 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  41.35 
 
 
446 aa  322  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  40.53 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  39.58 
 
 
476 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  37.3 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  39.7 
 
 
474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  38.64 
 
 
437 aa  306  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  38.64 
 
 
437 aa  306  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  39.51 
 
 
466 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  37.15 
 
 
437 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  37.3 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  37.28 
 
 
467 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  39.37 
 
 
446 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  34.66 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  34.72 
 
 
445 aa  265  8.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  35.28 
 
 
448 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  35.28 
 
 
448 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  35.56 
 
 
445 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  36.4 
 
 
467 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  38.44 
 
 
451 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  38.44 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  34.06 
 
 
447 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  36.73 
 
 
456 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  34.3 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  33.71 
 
 
744 aa  243  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  34.12 
 
 
436 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.57 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  36.55 
 
 
445 aa  233  8.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  30.61 
 
 
491 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.96 
 
 
452 aa  229  6e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  32.39 
 
 
474 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.11 
 
 
455 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.79 
 
 
455 aa  226  7e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  36.26 
 
 
443 aa  219  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.26 
 
 
445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  33.41 
 
 
441 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  30.06 
 
 
507 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  31.67 
 
 
447 aa  203  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  30.65 
 
 
418 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.74 
 
 
445 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  29.3 
 
 
472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  29.62 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  28.09 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  27.75 
 
 
412 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  27.72 
 
 
429 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  29.72 
 
 
416 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  29.86 
 
 
394 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  27.96 
 
 
421 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.2 
 
 
490 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  30.23 
 
 
417 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  27.35 
 
 
424 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  30.21 
 
 
408 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  27.15 
 
 
412 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  27.41 
 
 
408 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  27.41 
 
 
408 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  27.16 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  28.18 
 
 
425 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  26.96 
 
 
425 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  26.34 
 
 
413 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  28.47 
 
 
470 aa  141  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  27.09 
 
 
406 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  27.09 
 
 
410 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  27.13 
 
 
430 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  26.91 
 
 
429 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  27.34 
 
 
420 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  27.34 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4067  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  23.23 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  31.88 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2094  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  22.57 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0467874  hitchhiker  0.00000530734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  22.54 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  23.25 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000230391  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08860  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  29.94 
 
 
464 aa  57.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0311093  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1992  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  24.2 
 
 
466 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00736654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3396  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  23.93 
 
 
470 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3669  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.04 
 
 
469 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00445508  normal  0.10958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0063  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.33 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.165913  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05211  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.51 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.27 
 
 
472 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1845  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.74 
 
 
537 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3631  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  22.9 
 
 
453 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1049  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.77 
 
 
466 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148666  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2192  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.61 
 
 
466 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0448  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  23.57 
 
 
471 aa  53.5  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.483949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1073  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  27.87 
 
 
587 aa  53.5  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.312331  normal  0.927844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16560  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  31.33 
 
 
518 aa  53.5  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.351525  normal  0.0165029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2456  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  20.38 
 
 
465 aa  53.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4050  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  23.57 
 
 
469 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0243  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  20.85 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.390726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2723  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  32 
 
 
464 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2204  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  25.84 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  20.79 
 
 
455 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.15 
 
 
460 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.29 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3262  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25 
 
 
489 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3062  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.32 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0727112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0182  UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase  22.34 
 
 
512 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2112  UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase  32.82 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1277  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  25.83 
 
 
466 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1204  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  29.27 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>