97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2714 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  80.62 
 
 		 418 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  100 
 
 		 418 aa  846    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  62.53 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  64.04 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  62.29 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  54.18 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  51.64 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  50.71 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  46.15 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  44.76 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  44.12 
 
 		 416 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  47.68 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  43.86 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  43.77 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  42.11 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  42.82 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  42.56 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  42.56 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  42.72 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  41.33 
 
 		 425 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  43.08 
 
 		 406 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  36.99 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  30.43 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  29.98 
 
 		 445 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  29.93 
 
 		 448 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  29.93 
 
 		 448 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  29.75 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.51 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  34.58 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  33.41 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  32.24 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  32.24 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  30.44 
 
 		 445 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  29.35 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  30.3 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  31.09 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  29.66 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  27.91 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  30.59 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.16 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  28.85 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  31.77 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  30.75 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  33.26 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  28.34 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  33.75 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  30 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  28.03 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  32.33 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  30.77 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.51 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  31.46 
 
 		 744 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  29.98 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  26.38 
 
 		 467 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  31.08 
 
 		 472 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  29.98 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  31.88 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  25.28 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  25.28 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.21 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.53 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  30.97 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.38 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  29.25 
 
 		 430 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  29.24 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  25.43 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  36.36 
 
 		 490 aa  94  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2527  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  25.58 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12188  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  45.76 
 
 		 535 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000211725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.47 
 
 		 477 aa  50.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00131729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2483  Mur ligase middle domain protein  26.47 
 
 		 538 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2626  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.47 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000210646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  35.14 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3016  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  33.64 
 
 		 529 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1277  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  33.63 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1968  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.68 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0316215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3467  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  36.94 
 
 		 463 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.0184254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0349  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.26 
 
 		 487 aa  46.6  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.593739  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1657  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  31.18 
 
 		 532 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.13 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1114  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.82 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.713448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1005  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.6 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  0.0358362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3458  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.33 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.040004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2898  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase/UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase  23.53 
 
 		 1005 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0124721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  26.79 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.85 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3528  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  42.19 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.176869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1685  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  33.33 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2409  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.92 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  23.81 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0403  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  20.95 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00700  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate-- lysine ligase  26.74 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0050  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  26.24 
 
 		 516 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.046851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  32.64 
 
 		 538 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0162  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  26.72 
 
 		 516 aa  43.1  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3488  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.6 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4221  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  33.63 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>