More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0464 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0464  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  69.02 
 
 		 257 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  69.41 
 
 		 257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  69.41 
 
 		 257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  69.41 
 
 		 256 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  69.02 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  66.67 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  69.02 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  63.08 
 
 		 261 aa  313  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  63.14 
 
 		 256 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  61.02 
 
 		 256 aa  291  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  63.14 
 
 		 255 aa  289  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  59.46 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  59.07 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  57.14 
 
 		 269 aa  284  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  58.08 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1113  sorbitol dehydrogenase  59.54 
 
 		 262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  58.75 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  56.15 
 
 		 260 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  57.98 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  57.98 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  57.59 
 
 		 276 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  57.59 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  57.59 
 
 		 276 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  57.59 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  56.87 
 
 		 260 aa  274  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  57.81 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  55.51 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  51.75 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  50.59 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  39.92 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  41.9 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  37.94 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  37.79 
 
 		 268 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  36.61 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  37.55 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  37.7 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  37.3 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.11 
 
 		 260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.65 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  37.6 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  37.6 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0470  hypothetical protein  38.08 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.98 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  37.4 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  37.21 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  35.5 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.686314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  38.43 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.2 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0890906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.79 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.79 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.79 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.79 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.79 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.79 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>