181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3759 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3759  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  563  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5234  hypothetical protein  37.55 
 
 
239 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0033  hypothetical protein  37.02 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.809592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1644  hypothetical protein  34.38 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2511  hypothetical protein  48.08 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 
924 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 
930 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  39.39 
 
 
904 aa  49.3  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
931 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
932 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
932 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
931 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
932 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
932 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
934 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
934 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
934 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  55.26 
 
 
910 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 
900 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 
868 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 
899 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 
913 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00321  HNH endonuclease:HNH nuclease  42.59 
 
 
135 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.888481  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
910 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
932 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 
922 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
921 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  70.83 
 
 
918 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 
1067 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 
916 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 
962 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  46.81 
 
 
896 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  73.08 
 
 
962 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 
845 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  41.25 
 
 
283 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
936 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  58.82 
 
 
912 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
914 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
914 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
936 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
908 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 
909 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 
962 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
936 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 
915 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 
944 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  75 
 
 
923 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 
1024 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 
1024 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 
930 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  47.37 
 
 
921 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 
917 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 
1022 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
931 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
931 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 
921 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 
912 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
931 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  81.82 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
931 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
931 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
931 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
931 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3567  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 
908 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0529  hypothetical protein  32.65 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  0.851974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 
903 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 
917 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
907 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
907 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  62.5 
 
 
920 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 
896 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 
896 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
907 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  70.83 
 
 
908 aa  45.8  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
907 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  54.05 
 
 
898 aa  45.8  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 
921 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  41.67 
 
 
925 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 
893 aa  45.4  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1358  HNH nuclease  38.89 
 
 
136 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 
901 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
904 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  43.75 
 
 
917 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 
895 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 
1027 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
908 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
908 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
908 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
907 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 
901 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
909 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 
843 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 
843 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
908 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
904 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 
884 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 
908 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
901 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 
901 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>