12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0529 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  0.851974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1485  hypothetical protein  48.29 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2206  hypothetical protein  42.48 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1644  hypothetical protein  37.24 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3541  hypothetical protein  38.43 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0538  hypothetical protein  37.85 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1851  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2511  hypothetical protein  36.29 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.809592 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5234  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3759  hypothetical protein  32.65 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  53.66 
 
 		 148 aa  41.6  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>