More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0767 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2945  glycine cleavage H-protein  38.57 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2005  glycine cleavage H-protein  39.78 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1958  glycine cleavage H-protein  38.67 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1564  glycine cleavage H-protein  37.95 
 
 		 248 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1873  glycine cleavage H-protein  38.76 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1802  glycine cleavage H-protein  38.46 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1642  glycine cleavage H-protein  37.95 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2307  glycine cleavage H-protein  37.95 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0893702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  34.43 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  32.77 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  32 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  33.94 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  33.94 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  33.94 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  39.68 
 
 		 126 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  36.36 
 
 		 134 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  34.92 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  35.94 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  31.78 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  36.8 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  36.44 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  31.36 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  34.17 
 
 		 128 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  35.45 
 
 		 131 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 		 127 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  31.36 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  35.2 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  36.45 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  39.42 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  34.78 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2003  glycine cleavage H-protein  26.55 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1094  glycine cleavage system H protein  34.29 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.265813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0980  glycine cleavage system H protein  34.29 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.695732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  35.85 
 
 		 126 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  37.04 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  33.65 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  32.38 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  31.43 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  35.19 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  34.86 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  34.17 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  33.65 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  33.64 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  31.78 
 
 		 130 aa  72  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  31.58 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  29.92 
 
 		 135 aa  72  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  33.02 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  34.65 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  34.71 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  29.86 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  30.25 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  30.83 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  35.2 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  32.76 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  34.19 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  32.76 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  36.45 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  30.63 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  33.96 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  33.65 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  33.03 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  32.35 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  35.04 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  27.54 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  34.38 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  33.94 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  33.65 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  27.97 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  33.03 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  34.82 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  34.82 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  34.29 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  29.92 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  35.14 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  30.71 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  33.86 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  29.41 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  35.58 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  31.03 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  30.4 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  34.48 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  31.19 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1960  glycine cleavage H-protein  27.12 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  32.76 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  32.71 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  27.12 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  31.19 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>