More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17961 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  100 
 
 
131 aa  266  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  75 
 
 
129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  70.08 
 
 
129 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  69.53 
 
 
128 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  68.75 
 
 
128 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 
129 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
129 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 
129 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  48.84 
 
 
129 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 
130 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  47.69 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 
132 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 
127 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 
132 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 
127 aa  133  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 
131 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  47.66 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  48.28 
 
 
120 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 
126 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  48.28 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 
120 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  48.28 
 
 
120 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  48.7 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  45 
 
 
130 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  49.15 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  42.4 
 
 
129 aa  123  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  41.94 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 
128 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  41.6 
 
 
126 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  43.86 
 
 
120 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 
129 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 
127 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 
124 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 
126 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  121  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  42.15 
 
 
127 aa  120  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
129 aa  120  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 
127 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  42.37 
 
 
121 aa  120  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 
128 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  48.67 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  40.16 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 
120 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  41.8 
 
 
128 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  41.27 
 
 
126 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  45.16 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  39.34 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  39.34 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 
127 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  41.8 
 
 
126 aa  117  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  38.4 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  41.13 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  41.59 
 
 
122 aa  115  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  44.17 
 
 
135 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  42.5 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  43.33 
 
 
140 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  40.71 
 
 
122 aa  114  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  36 
 
 
125 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  43.22 
 
 
126 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  38.1 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  43.86 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  43.7 
 
 
126 aa  113  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  37.3 
 
 
126 aa  113  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  38.46 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 
128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>