More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3097 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  63.87 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  63.11 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  62.7 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  59.17 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  58.2 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  61.54 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  57.94 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  57.38 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  58.82 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  59.5 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  57.98 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  60.5 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  57.03 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  59.06 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  54.96 
 
 		 134 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 		 129 aa  137  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  55.04 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  57.6 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  57.6 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  57.6 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  53.54 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 142 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>