More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0717 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  100 
 
 
128 aa  251  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  79.69 
 
 
127 aa  201  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  67.19 
 
 
127 aa  178  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  67.19 
 
 
127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  59.84 
 
 
124 aa  152  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  56.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 
126 aa  135  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 
126 aa  135  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 
127 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 
129 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  52.71 
 
 
131 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
130 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  57.39 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
127 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 
128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 
128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 
126 aa  131  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 
129 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 
126 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 
129 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
129 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 
126 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  129  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  129  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 
129 aa  130  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  47.66 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 
127 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 
126 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  47.66 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  48 
 
 
126 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 
129 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 
129 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
127 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  42.19 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  48.46 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  50.38 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  44.35 
 
 
126 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 
130 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 
126 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
127 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 
128 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 
131 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
129 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  41.73 
 
 
129 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 
129 aa  124  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
129 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
129 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
129 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
129 aa  123  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>