More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1901 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  64.71 
 
 		 135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  56.9 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  55.67 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  48.6 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  43.31 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  45.61 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  43.59 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.47 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  47.22 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  48.25 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  47.5 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  42.06 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  43.7 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.12 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  48.54 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  49.11 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  47.37 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  44.27 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  43.97 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  43.97 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  45.54 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  45.38 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  49.07 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  47.22 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  42.61 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  46.9 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1539  glycine cleavage system protein H  44 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.463905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  46.49 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  40.65 
 
 		 130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  44.74 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  43.12 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  44.34 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  47.12 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  45.3 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  44.74 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  43.86 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  44.74 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  47.57 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  43.8 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  48.48 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>