More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1275 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  100 
 
 
129 aa  254  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  75.97 
 
 
129 aa  201  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  200  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  73.64 
 
 
129 aa  197  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  197  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  73.64 
 
 
129 aa  196  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
129 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
129 aa  193  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
129 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
129 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
129 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  70.54 
 
 
129 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  68.99 
 
 
129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  68.75 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  64.84 
 
 
128 aa  176  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  65.62 
 
 
128 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  65.62 
 
 
128 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  65.62 
 
 
128 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  62.79 
 
 
129 aa  174  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  64.34 
 
 
130 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  65.85 
 
 
129 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  65.57 
 
 
129 aa  173  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  65.04 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  62.02 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  63.49 
 
 
126 aa  170  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  63.49 
 
 
126 aa  170  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  61.48 
 
 
136 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  60.47 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  58.14 
 
 
131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  58.91 
 
 
130 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  60.47 
 
 
128 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  61.79 
 
 
126 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  59.38 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  56.15 
 
 
131 aa  153  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 
126 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 
126 aa  152  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 
126 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  59.84 
 
 
126 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 
129 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 
128 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 
126 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 
126 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 
153 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  58.59 
 
 
127 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  58.2 
 
 
126 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  58.59 
 
 
127 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 
130 aa  149  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 
130 aa  149  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  57.03 
 
 
127 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 
127 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  58.14 
 
 
128 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  60.17 
 
 
129 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 
126 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  61.54 
 
 
129 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  57.38 
 
 
126 aa  146  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  57.03 
 
 
127 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 
130 aa  144  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 
126 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 
126 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  56.78 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 
127 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 
130 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  52.38 
 
 
155 aa  140  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 
131 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  49.21 
 
 
130 aa  140  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 
125 aa  138  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 
126 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 
126 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>