More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5450 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  85.12 
 
 		 121 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  82.64 
 
 		 121 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  81.82 
 
 		 121 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  80.17 
 
 		 121 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  79.34 
 
 		 121 aa  197  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  82.64 
 
 		 121 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  62.81 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  63.87 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  63.48 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  63.72 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  62.5 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  64.6 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  58.33 
 
 		 123 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  62.83 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  61.54 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  58.68 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  60.87 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  61.54 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  64.04 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  61.95 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  58.62 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  58.62 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  61.61 
 
 		 125 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  61.4 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  60.17 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  63.16 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  63.16 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  61.61 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  57.98 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  54.39 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  52.17 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  53.78 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  56.14 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  50.83 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  52.63 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  52.59 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  52.21 
 
 		 125 aa  133  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.46 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  47.83 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  55.75 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  53.51 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  54.78 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  55.26 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  56.52 
 
 		 130 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  57.8 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  52.14 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  53.21 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.67 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  54.39 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  52.63 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50.88 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3206  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000136098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>