More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0712 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  97.54 
 
 		 122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  65.57 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  64.04 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  59.83 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  59.83 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  65.57 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  57.5 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  56.67 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  55 
 
 		 123 aa  146  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  58.47 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 120 aa  143  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  58.97 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  56.67 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  56.67 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.99 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  58.26 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  51.69 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  58.26 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 123 aa  139  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  60.87 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  60.68 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 124 aa  137  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 120 aa  136  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  52.21 
 
 		 122 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  57.85 
 
 		 129 aa  136  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  57.89 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  51.26 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  56.36 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  51.3 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  55.26 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2594  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.715495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  60.19 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  54.31 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  48.25 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3958  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  56.52 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  56.52 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>