More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0689 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  62.1 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  65.6 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  61.29 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  68.42 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  62.9 
 
 		 125 aa  157  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  62.18 
 
 		 123 aa  156  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  63.72 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  61.95 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  63.39 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  59.66 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  59.66 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  59.5 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  61.54 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  57.02 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  58.82 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  61.4 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  59.65 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  61.61 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 120 aa  147  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  54.7 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  54.7 
 
 		 124 aa  144  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  65.18 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  52.54 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  56.64 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.66 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  52.14 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  54.87 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1346  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>