More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0485 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  89.68 
 
 		 126 aa  230  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  89.68 
 
 		 126 aa  230  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  65.08 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  65.08 
 
 		 127 aa  173  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  65.08 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  65.08 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  65.08 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  65.08 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  65.08 
 
 		 127 aa  170  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  62.1 
 
 		 126 aa  166  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  61.9 
 
 		 127 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  62.1 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  55.2 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  54.76 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  52.76 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  56 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  56 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  47.73 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  56.2 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  57.39 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 127 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  50.88 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  47.2 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  47.01 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  50.85 
 
 		 160 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  44.72 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  46.28 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>