More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3298 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  48.84 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  53.6 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 132 aa  137  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  50 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  48.48 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  53.45 
 
 		 123 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  50.86 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.54 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  46.77 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  53.51 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  48.46 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  48.84 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2594  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.715495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  51.24 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>