More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1870 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  70.73 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  64.23 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  61.21 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  62.9 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  65.22 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  62.5 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  58.54 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  61.06 
 
 		 120 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  60.18 
 
 		 120 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  63.48 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  60.18 
 
 		 120 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  61.74 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  58.82 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  61.21 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  61.21 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 122 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  58.47 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  60.34 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  56.64 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  55.17 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  58.33 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  58.93 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  52.99 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  59.43 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  56.67 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  53.45 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  50.85 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  53.98 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  56.78 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  55.96 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  51.69 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.45 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  47.37 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.41 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01074  hypothetical glycine cleavage H-protein (Eurofung)  48.76 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  53.1 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  47.9 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  49.12 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>