More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3500 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  99.22 
 
 
129 aa  258  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  99.22 
 
 
129 aa  258  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  98.45 
 
 
129 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  97.67 
 
 
129 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  97.67 
 
 
129 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  97.67 
 
 
129 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  91.47 
 
 
129 aa  244  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  91.47 
 
 
129 aa  244  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  92.25 
 
 
129 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  89.92 
 
 
129 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  87.6 
 
 
129 aa  239  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  88.28 
 
 
129 aa  235  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  88.37 
 
 
129 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  72.87 
 
 
129 aa  204  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  75.78 
 
 
128 aa  199  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  73.02 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  72.09 
 
 
129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  72.09 
 
 
129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  72.66 
 
 
128 aa  192  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  72.66 
 
 
128 aa  192  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  72.66 
 
 
128 aa  192  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
130 aa  192  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  71.32 
 
 
130 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  70.4 
 
 
136 aa  192  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  65.89 
 
 
130 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 
126 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 
126 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  65.89 
 
 
129 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  63.57 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  66.41 
 
 
127 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  61.24 
 
 
130 aa  170  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  65.62 
 
 
127 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  61.42 
 
 
129 aa  167  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  64.52 
 
 
126 aa  166  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  69.23 
 
 
129 aa  166  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  64.84 
 
 
127 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  62.99 
 
 
130 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  66.1 
 
 
142 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  63.28 
 
 
127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  56.59 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  62.02 
 
 
128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  57.36 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  57.36 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  62.5 
 
 
127 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  56.69 
 
 
129 aa  161  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  60.63 
 
 
126 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  65.25 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  60.63 
 
 
126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  60.63 
 
 
126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  59.06 
 
 
126 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 
126 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  57.36 
 
 
130 aa  158  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  59.84 
 
 
153 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  58.59 
 
 
127 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  61.24 
 
 
128 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 
126 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 
126 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 
126 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 
126 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 
127 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 
128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3206  glycine cleavage system protein H  59.52 
 
 
128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  57.94 
 
 
127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  58.06 
 
 
126 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  58.06 
 
 
126 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  56 
 
 
128 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 
130 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 
125 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  59.68 
 
 
125 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  55.56 
 
 
155 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  59.02 
 
 
126 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 
131 aa  147  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  53.49 
 
 
131 aa  146  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>