More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2092 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  95.83 
 
 		 120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  82.5 
 
 		 120 aa  204  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  80 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  65.25 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  64.35 
 
 		 120 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  66.96 
 
 		 120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  65.22 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  65.22 
 
 		 120 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  61.86 
 
 		 120 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  64.04 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  61.34 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  64.1 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  59.66 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  62.39 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  59.83 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  62.61 
 
 		 122 aa  151  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  62.61 
 
 		 122 aa  151  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  60.68 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  62.39 
 
 		 121 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  61.54 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  61.06 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  62.83 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  59.66 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  60.18 
 
 		 123 aa  147  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  59.32 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  59.48 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  58.97 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  59.13 
 
 		 122 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  63.25 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  56.3 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  58.26 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  58.26 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  57.63 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  52.17 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3958  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 124 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  52.17 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.28 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0989  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1026  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.946369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  47.83 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  54.78 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  48.72 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  56 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  43.86 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  52.63 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  50.88 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4229  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.012135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  48.7 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  49.12 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>