More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2284 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  100 
 
 
129 aa  260  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  93.02 
 
 
129 aa  246  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  61.16 
 
 
126 aa  153  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 
127 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
126 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 
127 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 
126 aa  141  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 
126 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 
130 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  61.32 
 
 
129 aa  140  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 
125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  57.38 
 
 
127 aa  138  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
128 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 
128 aa  137  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 
129 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  54.1 
 
 
127 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 
129 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
130 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 
126 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 
126 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  56.41 
 
 
122 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
127 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 
126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  55 
 
 
126 aa  134  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 
126 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 
131 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50 
 
 
140 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
127 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 
126 aa  133  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 
127 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  53.45 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 
123 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  53.92 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 
127 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 
127 aa  130  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  46.61 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  56.44 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  55.34 
 
 
127 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 
120 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  57.85 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 
129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 
122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 
129 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 
129 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 
129 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 
129 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 
125 aa  127  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 
128 aa  126  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  60.4 
 
 
129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 
129 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 
127 aa  124  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 
127 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 
126 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 
129 aa  124  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>