More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1654 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  76 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  66.67 
 
 		 126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  68.8 
 
 		 126 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  63.49 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  59.68 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  59.52 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  58.73 
 
 		 126 aa  164  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  61.6 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  58.27 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  60.32 
 
 		 125 aa  146  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  54.84 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  46.77 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  47.86 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  50.44 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  50.91 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  47.93 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  48.7 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  49.6 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  49.57 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  46.28 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  48.76 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  49.12 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  48.21 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  45.97 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  44.74 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>