More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2194 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  94.07 
 
 		 118 aa  222  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  68.91 
 
 		 120 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  67.23 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2347  glycine cleavage system H protein  62.71 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 120 aa  141  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  57.02 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 120 aa  133  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  55.75 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  53.1 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  54.46 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  51.69 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  53.64 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  49.57 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  50.42 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  53.64 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  47.86 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  55.05 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  50.44 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  50.88 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  53.04 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1346  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  45.3 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  45.76 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.46 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  49.07 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  52.17 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>