More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2695 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 123 aa  244  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  70.73 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  68.33 
 
 		 123 aa  171  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  68.1 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  64.17 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  62.18 
 
 		 125 aa  156  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  63.33 
 
 		 121 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  62.5 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  62.5 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  60.66 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  62.5 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  62.5 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  61.86 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  63.03 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  62.83 
 
 		 120 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  61.16 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  63.33 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  59.48 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  56.1 
 
 		 123 aa  149  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  62.93 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  62.93 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  62.83 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  57.38 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  62.83 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  61.21 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  58.47 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  55.28 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 120 aa  141  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  60.18 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  59.13 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  58.87 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  52.59 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  58.26 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  61.67 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  61.47 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  55.75 
 
 		 130 aa  133  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  52.59 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  52.94 
 
 		 157 aa  131  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  49.12 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  51.75 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.15 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 123 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3096  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.01 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  55.66 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  51.75 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>