More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2200 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 125 aa  249  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  69.35 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  62.1 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  67.2 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  60.8 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  63.64 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  60.66 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  60.87 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  60.68 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  57.76 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  59.32 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  59.48 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  60.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  58.47 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  56.45 
 
 		 124 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  58.97 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  55.08 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  54.24 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  56.41 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  53.91 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  52.14 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  61.86 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  52.54 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  52.63 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 		 129 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  57.98 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  53.33 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1346  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0989  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1026  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.946369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  57.66 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52.63 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  49.12 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  59 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  49.14 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  50.89 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>