More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1525 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  93.02 
 
 		 129 aa  246  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  61.48 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  63.21 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  56 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 126 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  51.16 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  52.07 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  56.73 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  49.61 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  56.2 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  55.93 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  55.77 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  50.86 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  59.8 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  59.8 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  52.89 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  55.28 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>