More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1711 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  72.44 
 
 		 127 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  60.98 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  57.14 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  61.48 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  61.16 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  56.2 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  60.98 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  58.14 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  57.6 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  57.48 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 		 125 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  58.68 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  59.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  56.69 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  57.63 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  58.4 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  59.66 
 
 		 130 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  57.36 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.17 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  57.14 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  59.2 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  59.2 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  59.2 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  57.6 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  57.6 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  56.41 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  57.6 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  58.2 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  62.61 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  52.03 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  56.2 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  52.59 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  57.38 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  55.65 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  51.22 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  58.2 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  57.02 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  63.21 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  54.7 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  60.66 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  58.4 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  54.33 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>